Kolophon war eine der reichsten Städte Ioniens in der archaischen Zeit. Über den bronzezeitlichen Vorgänger ist wenig bekannt. Die Stadt erstreckte sich rund um das heutige Dorf Değirmendere im Bezirk İzmir. Ausgrabungen fanden nur einmal, für drei Wochen, im Jahr 1922 durch ein US-amerikanisches Team statt. Die Archäologen legten ein Tholosgrab frei und fanden mykenische Keramik.
Im Jahr 2000 leitete Nuran Şahin eine kleine Untersuchung auf dem Halil Ağa Tepesi (Hügel), bei der sie Überreste einer geometrischen und spätbronzezeitlichen Siedlung entdeckte.